Los orígenes del Departamento de Gerencia datan de 1926 cuando se funda la Facultad de Administración de Empresas en el Recinto de Rio Piedras de la Universidad de Puerto Rico. Desde sus comienzos esta unidad ha tenido la encomienda de proveer cursos fundamentales en el área de administración de empresas para gerentes y empresarios en Puerto Rico. En 1977 el Senado Académico aprobó una reevaluación de la concentración en Gerencia y se reorganizó la oferta académica en el Programa General y tres áreas de concentración: Mercadeo, Administración de los Recursos Humanos y Gerencia de Producción. Para entonces la unidad académica se conocía como Departamento de Administración y Derecho Mercantil.
En noviembre de 1996, la Facultad de Administración de Empresas aprobó un cambio de nombre de la unidad a Departamento de Gerencia. En los años subsiguientes se actualizaron los cursos del Departamento. Sin embargo, no fue hasta 2009 que se aprobaron las revisiones curriculares tanto del Programa General como de las tres concentraciones. Con esta revisión curricular el Programa General ofrece una mayor flexibilidad para que el estudiante escoja los cursos de interés u opte por un área de énfasis en empresarismo. Las tres concentraciones cambiaron a Gerencia de Mercadeo, Gerencia de Recursos Humanos y Gerencia de Operaciones y Suministros, ofreciendo también mayor flexibilidad a los estudiantes en la oferta académica. En agosto del 2022 se añadió a la oferta académica la concentración en emprendimiento.
Los esfuerzos coordinados del personal docente, no docente y estudiantes adscritos al Departamento de Gerencia contribuyeron en gran medida a que la Facultad de Administración de Empresas obtuviera la acreditación profesional del AACSB en marzo de 2014 . Como resultado todos los programas adscritos a dicha unidad están debidamente acreditados tanto por la MSA como el AACSB.