Una vez el estudiante completa su grado de bachillerato puede optar por estudios graduados. Los estudios graduados incluyen Certificaciones Profesionales, Maestrías o Doctorados. La Escuela Graduada de Administración de Empresas ofrece los grados de Maestría en Administración de Empresas y el Doctorado en Administración de Empresas. Ambos programas también están acreditados por el AACSB. El programa de Maestría en Administración de Empresas está más dirigido a la práctica en la ámbito empresarial mientras que el programa doctoral está dirigido a la investigación y práctica docente.
El estudiante con Bachillerato en Administración de Empresas o Bachillerato en Gerencia de Oficina también puede optar por hacer estudios graduados en otros campos afines. El Decanato de Estudios Graduados e Investigación provee información sobre otros programas graduados que se ofrecen en el Recinto de Río Piedras de la Universidad de Puerto Rico.